Bakım-onarım ve garanti hizmetleri, Çağrı Merkezi konsepti ile yürütülmektedir. Meteksan Çağrı Merkezi, müşterilerin tüm yazılım ve donanım problemlerini ve isteklerini iletebilecekleri tek iletişim noktasıdır. Müşteriler ile yapılan anlaşmalar çerçevesinde, tecrübeli ve konularında eğitimli uzmanlar, Meteksan Sistem’in sağladığı veya bakım hizmetlerini yürüttüğü ürünler ile ilgili soruları cevaplandırmak ve sorunlara çözüm getirmek üzere bu merkezde hazır bulunmaktadırlar.  Meteksan Sistem garantisi kapsamında olan veya sözleşme ile hizmet verilen müşteri talepleri, sahip oldukları hizmet seviyesine göre, karşılanması için teknik elemanlara yönlendirilir. Hizmet türüne göre verilen servis sonrası, müşterinin onayı alınır ve müşteri isteklerinin başarıyla karşılanıp karşılanmadığı telefon yoluyla takip edilir. Müşteriye ve sahip olduğu ürünlere ait bilgiler çağrı merkezi tarafından saklanır ve güncellenir.

Çağrı Merkezi, Ankara’da bulunup, kesintisiz olarak 7 gün 24 saat hizmet vermektedir. Bu merkeze ulaşım, telefon, faks ve internet aracılığı ile gerçekleştirilmektedir. Çağrı Merkezi faaliyetlerinin otomasyonu için Meteksan Sistem ve Bilgisayar Teknolojileri A.Ş. bünyesindeki yazılım uzmanları tarafından oluşturulmuş ve müşteri geri dönümleri ile geliştirilmiş bir program olan “Gökkuşağı” isimli özel ve çok yönlü bir yazılım kullanılmaktadır. Bu program, çağrılarının durumlarını takip etmek isteyen müşterilere ve sahada destek hizmetlerini gerçekleştirmekte olan mühendis ve teknisyenlere açıktır.

İlgili sistem bünyesinde, müşterilere ait tüm merkez ve şube bilgileri, gerekli kontak isim ve ulaşım bilgileri ile beraber tutulmaktadır. Aynı şekilde, müşteride yer alan, bakım veya onarım hizmeti verilmesi gereken ürünlerin envanteri tüm detayları ile bu sistemde kayıtlıdır. Gökkuşağı Sistemi, müşteri sözleşmelerinde yer alan özel durum (müdahale süresi, yeri, vb.) bilgilerini de saklamakta olup, gerekli zamanlarda uzmanlarımıza ilgili uyarıları yapmaktadır. Gökkuşağı Sistemi sayesinde, istenen periyotlarda raporlamalar sağlanarak, ilgili projelerin işleyişi hakkında detay ve kümülatif bilgilere de ulaşılmaktadır.